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微生物肥料改良土壤作用微生物肥料中有益微生物能产生糖类物质，占土壤有机质的0.1%，与植物粘液，矿物胚体和有机胶体结合在一起，可以改善土壤团粒结构，增强土壤的物理性能和减少土壤颗粒的损失，在一定的条件下，还能参与腐殖质形成。所以施用微生物肥料能改善土壤物理性状，有利于提高土壤肥力。另外还有将微生物肥料作为土壤净化剂使用。

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微生物菌肥的优势：有效预防农作物生长过程中的多种真菌病害。

在发酵过程中能产生多种抑菌物质，微生物菌剂，如乳酸、四羟基乳酸、3-乳酸、乳酸菌素等，这些物质可以有效抑制农作物病原菌；可以诱导作物抗性的提高，诱导作物植保酶：PAL（丙氨酸解氨酶）、POD（过氧化物酶）、PPO（多酚氧化酶）。这些酶的可以促进植物一些重要次生物质的合成，如木质素、异黄酮植保素、对病原菌有害的醌类物质。从而显著能增强植物的抗病能力。

微生物菌剂中的活性有益微生物菌及其他营养物质，在土壤中不断地生长发育繁殖，分泌大量的几丁质酶、生根素等物质作用于土壤中，微生物菌剂价格，同时调理了作物根系周围的土壤环境，能够实现酸碱平衡，并能有效改善土壤板结现象、重茬现象，使作物在健康的土壤环境中生长发育。微生物菌剂内含有特定的微生物，农业微生物菌剂，通过其生命活动促进植物营养元素的供应量吸收，有的还能释放并抑制有害微生物的形成。其作用机理有改善土壤的理化特性，提供植物所需的营养元素，改善植物对营养的吸收

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